Topic outline

  • General

    Las direcciones de mail del Area biolmol.unr@gmail.comqsp.qsan@gmail.com

    se encuentran fuera de servicio. Contactarse directamente con cada docente

    con las direcciones que figuran en los transparentes virtuales.

    Para quienes quieran cursar Quimica Superior de proteínas. Leer

    SE SOLICITA QUE TODOS AQUELLOS QUE DESEEN CURSAR QSP ESTE CUATRIMESTRE ENVIEN A LA BREVEDAD UN MAIL INDICÁNDOLO A:

    ECECCARE@FBIOYF.UNR.EDU.AR

    AQUELLOS QUE YA SE HABÍAN INSCRIPTO TAMBIEN DEBEN ENVIAR EL MAIL.

    Se solicita además obtengan una  clave de acceso en 

    https://comunidades.campusvirtualunr.edu.ar/

    Si ya posee una puede usar la misma. 

    A la brevedad se brindará más información por este medio y por correo electrónico

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    Frente a la actual situación generada por la actual pandemia del COVID-19 (coronavirus) se solicita que aquellos que necesiten realizar consultas se comuniquen con los docentes vía mail, a las siguientes direcciones:

    Dr. Eduardo A. Ceccarelli  ececcare@fbioyf.unr.edu.ar

    Dra. Daniela Rial                drial@fbioyf.unr.edu.ar

    Dra. Daniela Catalano:      catalano@ibr-conicet.gov.ar

     

     

  • Topic 1

    ANÓTESE POR MAIL PARA CURSAR ESTA ELECTIVA.

    PUEDE ENVIAR SU CONSULTA TAMBIEN BIOLMOL.UNR@GMAIL.COM

    • Topic 2

       

      Tema1: Preparación de ADN genómico de tejidos de mamíferos,plantas, células en cultivo y bacterias para la construcción de bibliotecas genómicas o para análisis posteriores. Obtención de ARN citoplásmico de eucariotas. Extracción dual de ADN y ARN. Cuantificación de ADN y ARN por espectrofotometría y fluorometría. Preparación de fragmentos de ADN de gran tamaño. Sistemas básicos de electroforesis de ADN.

      PROBLEMAS: 

      • Topic 3

        Tema 2: Amplificación de ADN por reacción de la polimerasa en cadena (PCR).

        Fundamentos. Condiciones generales del entorno, el equipamiento y los reactivos utilizados. Protocolos. Optimización. Diseño de cebadores.Utilización de la Reacción para detectar ADN en bajas cantidades. Detección de ARN. Falsos positivos y contaminaciones. Re-clonado mediante la utilización de PCR. Introducción de sitios, cambios de fase. Polimorfismo de ADN por amplificación al azar (RAPD). “Nested PCR”. Amplificación de marcadores. Interpretaciones VNTRS, STRs, Amplificación de ADN en bajo número de copia (“LCN testing”)

        PROBLEMAS:

        • Topic 4

          Tema3: Cuantificación de ADN y ARN . Mediante métodos convencionales en solución. Otros métodos mediante PCR. Métodos semicuantitativos y cuantitativos. PCR en tiempo real. Fundamentos, cálculos, errores y estrategias.

          PROBLEMAS:

          • Topic 5

            Tema 4: Detección de mutaciones conocidas (Diagnosis ). Hibridación con oligonucleótidos específicos. Utilización de PCR para determinación de mutaciones. ARMS.Generación y extinción de sitios de restricción. Multiplex PCR. Ejemplos de la aplicación de los métodos anteriores a la detección de agentes infecciosos y al estudio de alteraciones genéticas. Otros métodos para detectar mutaciones conocidas mediante técnicas de biología molecular. Determinación de SNPs

            PROBLEMAS: 

            • Topic 6

              Tema 5: Detección de mutaciones desconocidas en regiones determinadas ("screening”). Heteroduplex, SSCP, DGGE,fragmentación química, estudios de protección de digestión. Análisis de la síntesis de proteínas truncadas (PTT).

              PROBLEMAS :

              • Topic 7

                Tema 6: Mutagénesis de ADN clonado. Mutagénesis sitio dirigida sin selección fenotípica utilizando oligonucleótidos. Mutagénesis con oligonucleótidos degenerados. Síntesis de genes. Utilización de cepas especificas para mutagénesis. Diferentes sistemas para obtención de mutantes. Utilización de sistemas informáticos para la elección de sustituciones.

                Tema7: Mutagénesis al azar y evolución dirigida . Diferentes métodos. Utilización de errores de lapolimerasa para introducir mutaciones. DNA “shuffling”. “Domain shuffling”

                PROBLEMAS:

                • Topic 8

                  Tema 7: Métodos de alta resolución para el análisis de secuencias. Secuenciación manual y automática de ADN y ARN. Introducción a los métodos de secuenciación de ADN. Secuenciación por el método de terminadores de elongación de cadena y por métodos químicos. Análisis de datos de secuencia e interpretación de perfiles obtenidos en secuenciadores automáticos. Preparación de deleciones de ADN para secuenciación. Geles en condiciones desnaturalizantes. Aplicación para la detección de unión de proteínas a ADN. Amplificación utilizando Phi29 DNApol (RCA).

                  Pirosecuenciación. Colony PCR – “Deep sequencing”

                  PROBLEMAS: 

                  Teórico práctico:

                  • Topic 9

                    SEMANA DE PRÁCTICOS

                    SE ARMARÁN LOS GRUPOS Y SE DEFINIRÁN LOS HORARIOS

                    • Topic 10

                      Tema 8: Manejo de computadoras para estudio de ADN y ARN. Análisis y predicción. Diseño de oligos. Proyectos de secuenciación.Comparación de secuencias. Bancos de datos internacionales a través de sistemas de distribución y comunicación.

                      • Topic 11

                        PARCIAL (INCLUYE PROBLEMAS DESDE TEMA 1 a 7, más práctica)

                        • Topic 12

                          RECUPERATORIO